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生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)的快速發(fā)展推動(dòng)了診斷試劑向精準(zhǔn)化、快速化、便攜化方向升級(jí),其中核酸診斷試劑因直接靶向病原體或疾病相關(guān)基因,成為感染性疾病診斷、遺傳病篩查、腫瘤早篩等領(lǐng)域的核心產(chǎn)品。熒光定量PCR技術(shù)作為核酸檢測(cè)的“金標(biāo)準(zhǔn)”,其檢測(cè)性能直接決定診斷試劑的靈敏度、特異性及臨床適用性,而PCR儀的硬件性能是技術(shù)落地的關(guān)鍵支撐。
目前,國(guó)內(nèi)診斷試劑開(kāi)發(fā)領(lǐng)域?qū)Ω咝阅堋⒏咝詢r(jià)比的國(guó)產(chǎn)熒光定量PCR儀需求迫切。博清生物科技(南京)有限公司針對(duì)診斷試劑開(kāi)發(fā)的核心痛點(diǎn),研發(fā)了兼具精準(zhǔn)性與實(shí)用性的熒光定量PCR儀,在光學(xué)設(shè)計(jì)、溫控精度、軟件適配性等方面進(jìn)行專項(xiàng)優(yōu)化。
一、材料與方法
(一)實(shí)驗(yàn)儀器
博清生物熒光定量PCR儀,配備多通道光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng),溫控范圍4℃~100℃,升溫速率6℃/s,降溫速率6℃/s;進(jìn)口儀器為某品牌熒光定量PCR儀。
(二)實(shí)驗(yàn)材料
1、靶標(biāo)核酸:新冠病毒(S基因)、甲型流感病毒(HA基因)、大腸桿菌(uidA基因)重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品(濃度梯度101~10?copies/μL)。
2、試劑耗材:PCR反應(yīng)預(yù)混液(含Taq酶、dNTPs、熒光染料)、特異性引物探針(由生工生物合成)、無(wú)酶純水、臨床模擬樣本(滅活病毒液、細(xì)菌培養(yǎng)液、健康人血清)。
(三)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
1、反應(yīng)體系優(yōu)化
以新冠病毒S基因?yàn)榘袠?biāo),采用博清生物PCR儀,設(shè)置引物濃度(0.2~0.5μmol/L)、探針濃度(0.1~0.3μmol/L)、退火溫度(55~65℃)三因素三水平正交實(shí)驗(yàn),以Ct值、擴(kuò)增效率(E)為評(píng)價(jià)指標(biāo),篩選最優(yōu)反應(yīng)體系。
2、特異性驗(yàn)證
選取新冠病毒、甲型流感病毒、大腸桿菌及人類管家基因(GAPDH)核酸樣本,使用優(yōu)化后的反應(yīng)體系進(jìn)行擴(kuò)增,驗(yàn)證儀器對(duì)特異性引物探針的識(shí)別能力。
3、靈敏度與線性范圍檢測(cè)
采用101~10?copies/μL的質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品,進(jìn)行3次重復(fù)檢測(cè),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,計(jì)算線性相關(guān)系數(shù)(R2)、擴(kuò)增效率,確定儀器的檢測(cè)下限(LOD)。
4、重復(fù)性評(píng)估
對(duì)103、10?、10?copies/μL三個(gè)濃度的標(biāo)準(zhǔn)品,分別進(jìn)行批內(nèi)(n=8)和批間(n=3,連續(xù)3天)檢測(cè),計(jì)算Ct值的變異系數(shù)(CV)。
5、臨床樣本適配性驗(yàn)證
使用優(yōu)化后的診斷試劑配方,對(duì)50份臨床模擬樣本(含25份陽(yáng)性樣本、25份陰性樣本)進(jìn)行檢測(cè),對(duì)比博清生物PCR儀與進(jìn)口儀器的檢測(cè)一致性。
二、結(jié)果與分析
(一)反應(yīng)體系優(yōu)化結(jié)果
正交實(shí)驗(yàn)顯示,當(dāng)引物濃度0.3μmol/L、探針濃度0.2μmol/L、退火溫度60℃時(shí),擴(kuò)增效果最佳。此時(shí)Ct值平均為22.3±0.5,擴(kuò)增效率E=98.7%,符合診斷試劑開(kāi)發(fā)的效率要求(90%~110%)。博清生物PCR儀的精準(zhǔn)溫控能力的體現(xiàn),可快速鎖定最優(yōu)退火溫度,縮短體系優(yōu)化周期。
(二)特異性驗(yàn)證結(jié)果
僅靶標(biāo)核酸樣本出現(xiàn)特異性擴(kuò)增曲線,非靶標(biāo)樣本及空白對(duì)照均無(wú)擴(kuò)增信號(hào),交叉反應(yīng)率為0。表明該儀器的光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng)可有效區(qū)分特異性熒光信號(hào)與背景噪音,保障診斷試劑的特異性。
(三)靈敏度與線性范圍
標(biāo)準(zhǔn)曲線分析顯示,在101~10?copies/μL濃度范圍內(nèi),R2=0.999,擴(kuò)增效率E=99.2%。檢測(cè)下限(LOD)為101copies/μL,與進(jìn)口儀器檢測(cè)結(jié)果一致,滿足臨床診斷試劑對(duì)低濃度樣本的檢出需求。
(四)重復(fù)性表現(xiàn)
批內(nèi)檢測(cè)CV值為1.2%~2.5%,批間檢測(cè)CV值為1.8%~2.8%,均低于3%的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)。說(shuō)明博清生物PCR儀的溫控穩(wěn)定性和光學(xué)檢測(cè)一致性良好,可保障診斷試劑批間差異控制在合理范圍。
(五)臨床樣本適配性
50份臨床模擬樣本檢測(cè)中,博清生物PCR儀與進(jìn)口儀器的陽(yáng)性檢出率均為100%,陰性符合率100%,一致性kappa值=1.0。表明該儀器可適配臨床樣本基質(zhì),滿足診斷試劑臨床驗(yàn)證階段的檢測(cè)需求。
三、討論
診斷試劑開(kāi)發(fā)的核心訴求是兼顧性能可靠性與開(kāi)發(fā)效率,而PCR儀的硬件性能直接影響試劑配方優(yōu)化、性能驗(yàn)證的周期與效果。博清生物科技(南京)有限公司研發(fā)的熒光定量PCR儀在本次實(shí)驗(yàn)中展現(xiàn)出三大核心優(yōu)勢(shì):
首先,精準(zhǔn)的溫控系統(tǒng)與多通道光學(xué)設(shè)計(jì),保障了反應(yīng)體系優(yōu)化的高效性和特異性驗(yàn)證的準(zhǔn)確性。其快速升降溫能力可將單次擴(kuò)增周期縮短至40分鐘內(nèi),相比傳統(tǒng)儀器提升30%效率,顯著加快試劑開(kāi)發(fā)進(jìn)程。
其次,寬線性范圍與高靈敏度,可覆蓋從低濃度病原體檢測(cè)到高濃度樣本定量的全場(chǎng)景需求,適用于感染性疾病早期診斷、療效監(jiān)測(cè)等不同用途的試劑開(kāi)發(fā)。
最后,良好的兼容性與重復(fù)性,使其可適配市面上主流的PCR預(yù)混液、引物探針,且批間差異小,為診斷試劑的產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)提供了穩(wěn)定的檢測(cè)平臺(tái)。
與進(jìn)口儀器相比,博清生物熒光定量PCR儀在核心性能指標(biāo)上已實(shí)現(xiàn)持平,且在軟件操作的本土化適配、售后響應(yīng)速度等方面更具優(yōu)勢(shì),可降低國(guó)內(nèi)診斷試劑企業(yè)的開(kāi)發(fā)成本與技術(shù)門(mén)檻。
博清生物科技(南京)有限公司研發(fā)的熒光定量PCR儀憑借精準(zhǔn)的溫控性能、高靈敏度的光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng)及良好的兼容性,可高效適配診斷試劑開(kāi)發(fā)的全流程,包括反應(yīng)體系優(yōu)化、特異性驗(yàn)證、靈敏度標(biāo)定及臨床樣本驗(yàn)證。其核心性能達(dá)到行業(yè)先進(jìn)水平,能為生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)中核酸診斷試劑的快速開(kāi)發(fā)與產(chǎn)業(yè)化提供可靠技術(shù)支撐,助力國(guó)產(chǎn)診斷試劑的自主創(chuàng)新與市場(chǎng)推廣。未來(lái)可進(jìn)一步拓展儀器在數(shù)字PCR、多重檢測(cè)等高端應(yīng)用場(chǎng)景的適配性,滿足更復(fù)雜的診斷試劑開(kāi)發(fā)需求。
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